En Agriculture bio, le recours à des engrais chimiques de synthèse n’est pas permis. l’utilisation d’engrais verts, la rotation et l’utilisation de légumineuses sont essentielles à la gestion de la fertilité des sols. L’apport d’effluents d’élevage est complémentaire de ces pratiques. Il est important pour l’amélioration de la richesse et de la structure du sol ainsi que pour son équilibre. La présence d’animaux sur l’exploitation est un avantage considérable. L’utilisation des effluents permet d’équilibrer les exportations en azote, phosphore potassium.
En AB, l’utilisation de ces effluents, qu’ils proviennent de l’exploitation bio ou pas, est réglementée.